Seminar Details
2006-03-16 (17.00 pm) : Colloquium CESAME/MAPA "Applications de la théorie des graphes pour l'analyse des réseaux métaboliques "
At Auditoire Ch.-J. de La Vallée Poussin (cycl 01)
Organized by Mathematical Engineering
Speaker :
Jacques Van Helden (ULB)
Abstract :
Les processus biologiques sont assurés par des interactions entre
différents types de molécule : métabolites (petites molécules),
protéines, acides nucléiques,
Les réactions métaboliques, qui
permettent de convertir des groupes de molécules en autres molécules,
ont été caractérisées depuis plus dun siècle par les biochimistes.
Plus récemment, les méthodes « à haut débit », ont permis la détection
systématique des interactions protéines-protéines ou protéines-ADN, à
léchelle dun génome. Les données accumulées peuvent être représentées
sous la forme de graphes dinteractions, regroupant plusieurs milliers
de nuds et darcs. Nous présenterons différentes méthodes qui sont mises
à contribution pour analyser les propriétés de ces graphes, afin dinférer
les propriétés biologiques des processus quils représentent. Nous
traiterons notamment de lanalyse topologique, de la détection de motifs,
et de linférence de voies métaboliques par recherche de chemins dans les
graphes de réactions.